| 區別 | 縣市別 | 漁港 |
| 第一類 | 第二類 |
| 北區 | 宜蘭縣（11處） | 南方澳（1處） | 烏石、大溪第一、大溪第二、梗枋、石城、大里、粉鳥林、南澳、桶盤堀、蕃薯寮（10處） |
| 基隆市（6處） | 正濱、八斗子
（2處） | 外木山、大武崙、望海巷、長潭里（4處） |
| 臺北縣 （30處） | | 磺港、萬里、富基、淡水第二、澳底、鼻頭、東澳、馬崗、福隆、龍洞、龜吼、和美、石門、美豔山、水湳洞、南雅、卯澳、水尾、 深澳、野柳、草里、麟山鼻、中角、淡水第一、六塊厝、下罟子、後厝、老梅、龍門、澳仔（30處） |
| 桃園縣 （2處） | | 竹圍、永安（2處） |
| 新竹市 （2處） | 新竹（1處） | 海山（1處） |
| 新竹縣 （1處） | | 坡頭 （1處） |
| 中 區 | 苗栗縣 （12處） | | 公司寮、外埔、苑裡、龍鳳、通霄、苑港、青草、塭仔頭、福寧、南港、白沙屯、新埔（12處） |
| 臺中縣 （6處） | 梧棲（1處） | 五甲 、松柏、北汕、塭寮、麗水（5處） |
| 彰化縣（2處） | | 王功、崙尾灣（2處） |
| 雲林縣（6處） | | 臺子村、金湖、箔子寮、三條崙、臺西、五條港（6處） |
| 南區 | 嘉義縣（9處） | | 布袋、東石、副瀨、好美里、下庄、網寮、塭港、鰲鼓、白水湖（9處） |
| 臺南市（2處） | | 四草‧安平（2處） |
| 臺南縣（6處） | 將軍（1處） | 馬沙溝、青山、北門、下山、蚵寮（5處） |
| 高雄市（11處） | 前鎮（1處） | 鼓山、中洲、旗后、上竹里、小港、大汕頭、小港臨海新村、小港第十、旗津、鳳鼻頭（10處） |
| 高雄縣（8處） | | 興達、中芸、永新、汕尾、蚵子寮、彌陀、港埔、白砂崙（8處） |
| 屏東縣 （25處） | 東港鹽埔（1處） | 後壁湖、興海、山海、旭海、中山、琉球新、水利村、枋寮、海口、小琉球、天福、塭豐、楓港、射寮、後灣、萬里桐、紅柴坑、潭仔、香蕉灣、鼻頭、南仁、大福、杉福、漁福（24處） |
| 澎湖縣（67處） | | 馬公、龍門、赤崁、赤馬、風櫃東、時裡、菜園、鎖港、尖山、沙港東、合界、大池、竹灣、內垵北、內垵南、外垵、西衛、風櫃西、果葉、沙港中、白坑、南北寮、山水、前寮、重光、沙港西、港子、通樑、後寮、橫礁、潭門、七美、虎井、桶盤、石泉、吉貝、鳥嶼、員貝、將軍南、將軍北、鳥崁、案山、鐵線、五德、井垵、安宅、青螺、中西、成功、西溪、紅羅、瓦硐、城前、講美、鎮海、岐頭、小門、池西、大果葉、二崁、水垵、潭子、大倉、東吉、東嶼坪、花嶼、中社（67處） |
| 東區 | 花蓮縣 （3處） | | 花蓮、石梯、鹽寮（3處） |
| 臺東縣 （14處） | | 伽藍、大武、小港、新港、金樽、綠島、長濱、烏石鼻、新蘭、公館、溫泉、中寮、朗島、開元港（14處） |
| 金門縣 （3處） | | 新湖、羅厝、復國墩 （3處） |
| 連江縣（5處） | | 福澳、白沙、青蕃、猛澳、中柱（5處） |
| 總 計 | 8處 | 223處 |
